Organizacje studenckie
- Samorząd Studentów UJ CM
- Studenckie Towarzystwo Naukowe UJ CM
- Studenckie Towarzystwo Diagnostów Laboratoryjnych UJ CM
- Akademicki Związek Sportowy UJ CM
- IFMSA-Poland
- Polskie Towarzystwo Studentów Stomatologi
- Polskie Towarzystwo Studentów Farmacji UJ CM
Organizacje pracownicze
- Międzyzakładowa Komisja NSZZ Solidarność UJ CM, Szpitala Uniwersyteckiego i Uniwersyteckiej Kliniki Stomatologicznej
- Związek Zawodowy Pracowników Uniwersytetu Jagiellońskiego – Collegium Medicum i Uniwersyteckich Podmiotów Leczniczych
- Kasa Zapomogowo-Pożyczkowa
